Endoskopi er en undersøgelse, som udføres under narkose; dyrlægen fører en lang fiberkikkert ned i maven og videre ud i tarmen. Man kan også kikke op i endetarmen og videre op i tyktarmen.
På denne måde undersøger man det meste af tarmkanalen. Dette kan være et hjælpemiddel til at finde fremmedlegemer i maven, men især har endoskopi sin berettigelse til undersøgelse af kronisk syge mave/tarm patienter.
Det er muligt uden gene for hunden at udtage små vævsprøver, som kan undersøges på et laboratorium og dermed være medvirkende til at give en helt nøjagtig diagnose. Herved sikrer man sig, at behandlingen af en mave/tarmlidelse bliver så god, som det er muligt.